Atos, avec ses partenaires co-traitants EOLAS et A2COM a été sélectionné par le GCS AURAGEN afin de fournir et d'orchestrer l'infrastructure de calcul haute performance et de stockage de la plateforme génomique pilote de séquençage à très haut débit sélectionnée dans le cadre du plan « France Médecine Génomique 2025 ». Eolas apportera son expertise en matière d'hébergement sécurisé.

L'objectif de ce plan national est d'intégrer le séquençage de génomes individuels dans le parcours de soin afin de permettre une prise en charge diagnostique et thérapeutique personnalisée des patients. Il concernera principalement, dans un premier temps, les personnes atteintes de cancer et de maladies rares pour lesquelles de nouvelles stratégies thérapeutiques pourront être proposées en fonction des variations génétiques identifiées.

Une solution industrielle dimensionnée pour soutenir l'ensemble du cycle de vie de la donnée génomique, depuis le séquençage de l'ADN jusqu'à la production de l'analyse, est mise en oeuvre. Afin de développer une architecture au plus près des besoins de l'écosystème santé, Atos a réuni de multiples expertises métier (afin d'échanger avec les biologistes, généticiens et bio-informaticiens) et techniques (afin de mener des opérations de dimensionnement, analyse comparative, stockage, archivage, réseau haut débit).

L'architecture ainsi développée est majoritairement basée sur une infrastructure de technologie Dell/EMC qui permet de répondre aux forts besoins de stockage et aux enjeux de performance et d'évolutivité du projet (2,5 Po de données par an à terme). Atos, avec ses partenaires EOLAS et A2COM, garantit l'hébergement des données sur un site certifié HDS (Hébergement de Données de Santé), exploite et maintient l'ensemble de la plateforme pour le GCS AURAGEN.

Pour en savoir plus : Atos

[1] GCS AURAGEN : Groupement de Coopération Sanitaire rassemblant les 4 CHUs de la région Auvergne-Rhône Alpes (Grenoble, Lyon, St Etienne, Clermont-Ferrand), les 2 Centres de Lutte contre le Cancer de la région Auvergne-Rhône Alpes (Léon Bérard à Lyon et Jean Perrin à Clermont-Ferrand) et l'Institut de Cancérologie de la Loire. Outre le GCS et ses institutions, le consortium rassemble les Universités : Claude Bernard Lyon 1, l'Université de Grenoble, l'Université de St Etienne, l'Université de Clermont Ferrand ainsi que l'école des Mines de Saint Etienne et La fondation Synergie Lyon Cancer.

[2] Le Plan France Médecine Génomique 2025 prévoit de déployer dans les 4 ans à venir un réseau de douze plateformes de séquençage couvrant l'ensemble du territoire français. Deux projets pilotes ont été retenus, dont celui du GCS AURAGEN - informations ici.

La Sté Business & Decision SA a publié ce contenu, le 19 juillet 2019, et est seule responsable des informations qui y sont renfermées.
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