Les autorités taïwanaises ont informé le gouvernement sud-coréen qu'elles ont reçu des signaux de détresse du Kyoto 1 vers 9h50 (0050 GMT) jeudi, a déclaré le ministère, ajoutant que les six personnes à bord étaient des ressortissants sud-coréens.
Le navire de 322 tonnes, battant pavillon de la Sierra Leone, se dirigeait vers le port de Batam en Indonésie depuis la ville sud-coréenne de Busan en remorquant l'annexe Kyoto 2, qui a été retrouvée dans la zone.
Le ministère a lancé une équipe d'intervention d'urgence et a envoyé un navire de patrouille et des hélicoptères pour soutenir l'opération de recherche, a-t-il ajouté.
Dans un autre accident, l'un des hélicoptères se dirigeant vers Taïwan s'est écrasé dans les eaux au large de l'île de Mara, la plus méridionale de la Corée du Sud, vendredi, tuant deux pilotes et un troisième étant porté disparu, a rapporté l'agence de presse Yonhap, citant des responsables des garde-côtes.
