Le Nikkei a clôturé en baisse de 2,66 % à 27 878,96, avec 202 actions en baisse, 20 en hausse et trois stagnantes sur les 225 composants.
Le secteur industriel a connu la plus forte baisse, suivi du sous-indice technologique. L'énergie a été le seul secteur à progresser, soutenu par une reprise des prix du pétrole brut.
L'indice plus large Topix a chuté de 1,79 % à 1 944,10.
L'indice américain S&P 500 a dégringolé de 3,37 % vendredi et le Nasdaq, à forte composante technologique, a baissé de 4,1 %. Les contrats à terme sur le S&P 500 et le Nasdaq ont indiqué de nouvelles pertes pour lundi, glissant respectivement de 0,87% et de 1,22%.
Les traders ont augmenté à 70,5 % les paris sur une nouvelle hausse des taux de 75 points de base lors de la prochaine réunion du Comité fédéral de l'open market les 20 et 21 septembre.
"Il y a une chance décente de voir un rebond des actions américaines aujourd'hui", d'un point de vue technique, a déclaré Kazuo Kamitani, stratège chez Nomura Securities.
"Si c'est le cas, les actions japonaises devraient également augmenter progressivement. Mais si les actions américaines chutent à nouveau, les actions japonaises devraient continuer à glisser vers 27 000 en vue de la prochaine réunion du FOMC."
L'exploitant de magasins Uniqlo, Fast Retailing, a été le principal frein au Nikkei, perdant 84 points avec une baisse de 2,8 %.
Le fabricant d'équipements de fabrication de puces électroniques Tokyo Electron a suivi, perdant 82 points avec une baisse de 5,1 %. Son homologue Advantest a perdu 4,19 %.
L'investisseur de start-ups SoftBank Group a perdu 44 points sur le Nikkei, ce qui en fait le troisième plus grand frein, avec une baisse de 3,66 %.
Certaines valeurs automobiles ont été parmi les gagnantes, car la chute du yen à son plus bas niveau depuis plus d'un mois par rapport au dollar a stimulé les revenus des ventes à l'étranger.
Isuzu a gagné 2,24 %, Mazda 0,99 % et Subaru 0,78 %.
Les plus grands constructeurs automobiles ont chuté, avec une baisse de 0,85 % pour Toyota et de 0,69 % pour Nissan.
Honda a enregistré un gain de 0,41% après avoir glissé lors de la séance du matin.