Mardi, le pays a signalé une augmentation sans précédent de 14 207 nouveaux cas, avec un record de 4 166 infections à Tokyo, ville hôte des Jeux olympiques.
Les résultats financiers décevants de Ricoh ont également pesé sur l'indice, qui a chuté de 11,87 %.
L'indice Nikkei, à forte composante technologique, a terminé la séance du matin en hausse de 0,34 %, dépassant de peu la hausse de 0,26 % de l'indice général Topix, les actions technologiques ayant suivi la fermeté de Wall Bourse.
L'indice de croissance Topix a augmenté de 0,37 %, dépassant la progression de 0,15 % de l'indice de valeur.
"On continue de craindre que le marché boursier japonais soit trop lourd, mais une série de bénéfices positifs semble avoir amélioré le sentiment", a déclaré un acteur du marché dans une société de valeurs mobilières nationale.
Le Nikkei n'a cessé de reculer après avoir atteint un sommet de plusieurs décennies au-dessus de 30 000 à la mi-février, et a oscillé dans une fourchette d'environ 27 300-28 000 depuis la mi-juillet.
Nippon Yusen a été la meilleure performance du Nikkei, avec un bond de 8,8 %. Les autres transporteurs Mitsui OSK Lines ont progressé de 6,04 % et Kawasaki Kisen de 3,85 %.
Le transport maritime a été de loin le meilleur sous-secteur du Topix, avec une hausse de 7,05 %.
La société d'infrastructure et d'énergie Hitachi Zozen a progressé de 7,19 %, tandis que le groupe Sony a augmenté de 2,08 %.
Le groupe Rakuten a progressé de 7,5 % après que la société a conclu un partenariat pour construire un nouveau réseau mobile en Allemagne. (Reportage de l'équipe des marchés de Tokyo ; édition par Uttaresh.V)
