NanoString Technologies, Inc. a annoncé la publication du premier ensemble de données publiques du transcriptome entier obtenu à une véritable résolution unicellulaire sur l'imageur moléculaire spatial CosMx ? Spatial Molecular Imager (SMI). Ces données seront présentées lors de la 42e conférence annuelle J.P. Morgan Healthcare Conference 2024 à San Francisco, au cours de la présentation de NanoString le 10 janvier 2024, à 17 h 15 (heure de l'Est).

Le panel transcriptomique complet CosMx atteint un objectif scientifique ambitieux : NanoString est la première société à réaliser une percée scientifique en fournissant une véritable imagerie du transcriptome entier d'une cellule unique. Cette étape technologique a été franchie grâce à la plateforme CosMx SMI qui permet aux chercheurs de visualiser simultanément l'expression de chaque gène codant pour une protéine dans le génome humain in situ, offrant ainsi la capacité ultime pour la biologie spatiale de la cellule unique. Le CosMx Whole Transcriptome Panel transforme la possibilité d'extraire des informations biologiques à partir d'échantillons de tissus fixés au formol et inclus en paraffine (FFPE).

Grâce à l'imagerie de l'expression de près de 19 000 gènes à la fois, ce produit offrira une couverture près de 40 fois supérieure à celle des tests actuellement commercialisés par les plateformes concurrentes. Les chercheurs peuvent désormais explorer des millions de cellules par expérience, identifier des types de cellules rares et comprendre les interactions cellule-cellule dans un contexte spatial, ce qui permet une compréhension globale des paysages cellulaires qui n'a jamais été accessible auparavant. Ces capacités seront disponibles à un coût inférieur par cellule unique tout en offrant un débit cellulaire plus élevé que le séquençage traditionnel de l'ARN d'une cellule unique (scRNA-seq). NanoString prévoit de lancer commercialement le CosMx Whole Transcriptome Panel en 2025.

NanoString marque cette étape importante avec la publication d'un ensemble de données CosMx SMI générées à partir d'échantillons FFPE de tissu pancréatique humain sain. Cet ensemble de données, le premier du genre, démontre la biologie fonctionnelle du pancréas en révélant des types de cellules rares qui sont généralement perdus avec les méthodes traditionnelles de scRNA-seq. Cet ensemble de données a été généré à l'aide d'une version prototype du panel et du logiciel associé, et les performances de la nouvelle capacité devraient s'améliorer dans la version commerciale complète, devenant encore plus impressionnantes au fil du temps.

Anticipant un vif intérêt de la part de la communauté scientifique, NanoString présentera les capacités du transcriptome entier de CosMx SMI lors de présentations à la prochaine réunion de l'AGBT à Orlando, en Floride, du 5 au 8 février 2024. Les clients qui ont eu accès aux prototypes du CosMx Whole Transcriptome Panel présenteront des ensembles de données générées sur le cancer du pancréas, le cancer colorectal et le cerveau humain.

NanoString reste également en bonne voie pour commencer la livraison commerciale du CosMx Human 6K Discovery Panel à partir du premier trimestre 2024. Ce panel innovant, qui offre un plex 6x plus élevé que les panels CosMx SMI actuels, permettra aux chercheurs d'approfondir les états et fonctions cellulaires, d'explorer les interactions complexes entre cellules, et de fournir de nouvelles informations sur les réponses cellulaires spatiales à un niveau sans précédent.