10x Genomics, Inc. a annoncé les premières expéditions commerciales de sa plateforme Xenium pour l'analyse in situ. Xenium est la prochaine génération de profilage spatial ciblé de gènes et de protéines à une résolution subcellulaire. La plateforme comprend un instrument polyvalent et facile à utiliser, un menu varié de panels curés, personnalisables et de haute qualité, et Xenium Explorer, un logiciel intuitif pour la visualisation interactive des données.

En s'appuyant sur sa vitesse et son débit de pointe, Xenium permet la cartographie subcellulaire de centaines de cibles ARN, générant des données de haute qualité avec une sensibilité et une spécificité élevées pour révéler de nouvelles perspectives sur la structure et la fonction cellulaires. Le séquençage et l'imagerie de nouvelle génération ont produit des données spectaculaires et affiné la résolution des cellules en action, mais les deux domaines se sont développés séparément. La haute résolution cellulaire de la plateforme Xenium permet aux chercheurs d'évaluer la relation entre la structure et la fonction cellulaires, directement dans les tissus, sans avoir recours au séquençage ; elle jette un pont entre les mondes de la génomique et de la pathologie.

Voici quelques caractéristiques clés de la plateforme Xenium : Une vitesse et un débit de premier ordre. Xenium dispose d'une très grande surface imageable et est l'instrument In SiSitu au débit le plus élevé de sa catégorie. Avec Xenium, les chercheurs peuvent analyser la plus grande surface de tissu, à une résolution de molécule unique, en un minimum de temps.

Large menu de panels de gènes. La plateforme Xenium propose un menu varié de contenus définis, validés et biologiquement pertinents, avec la possibilité d'ajouter un grand nombre de gènes personnalisés. Avec le lancement de l'analyseur Xenium, 10x Genomics introduit deux panels ciblés, compatibles avec une large gamme d'échantillons frais congelés et FFPE, qui peuvent être personnalisés pour des questions de recherche spécifiques.

10x Genomics prévoit d'introduire des panels supplémentaires, spécifiques au type de tissu et à l'application, en 2023. Compatibilité avec la pathologie standard, y compris H&E. Xenium est conçu pour laisser la morphologie des tissus intacte. Cela permet d'obtenir des informations supplémentaires à partir de la même section de tissu après l'analyse, ce qui permet aux chercheurs d'examiner les correspondances entre les données moléculaires et les images morphologiques.

Analyse complète à bord. Xenium propose une analyse des données primaires et secondaires sur l'instrument, y compris la segmentation cellulaire, parallèlement à l'exécution de l'instrument. Cela permet une exploration directe des données sans traitement supplémentaire hors instrument, ce qui accélère le délai d'obtention des résultats et réduit considérablement la charge de calcul des clients.

Le logiciel de visualisation interactive Xenium Explorer. Aujourd'hui, la société a également lancé Xenium Explorer, son logiciel de bureau facile à utiliser pour l'exploration interactive et l'analyse des données. Xenium Explorer exploite la sortie prête à l'exploration de la plateforme pour permettre aux chercheurs de voir immédiatement les résultats à l'échelle subcellulaire et tissulaire.

Avec Xenium, les chercheurs ont également la possibilité d'utiliser des sorties de données spatiales monocellulaires de format standard et de nouvelles normes ouvertes avec des outils d'analyse développés par la communauté.