Singular Genomics Systems, Inc. a dévoilé le séquenceur spatial G4X. Le G4X est conçu pour offrir un séquençage direct in situ à haut débit de l'ARN (Direct-Seq ?), une transcriptomique ciblée et un profilage protéomique à partir de tissus fixés au formol et inclus dans la paraffine (FFPE). Le G4X partagera la même plateforme que le séquenceur G4® existant et devrait être le premier instrument à double usage de l'industrie offrant à la fois des capacités de NGS traditionnelles et de séquençage spatial à partir de tissus.

Avec l'ajout de la multiomique à haut débit et de la nouvelle technologie Direct-Seq à son portefeuille avec le G4X, Singular est en mesure de devenir la seule entreprise au monde à offrir le séquençage spatial in situ des tissus et le NGS sur le même instrument. Le séquenceur spatial G4X est conçu pour offrir de nouvelles capacités, des flux de données empilables et un débit sans précédent pour le profilage spatial des tissus. Parmi ses nouvelles fonctionnalités, citons Direct-Seq, qui est le séquençage des molécules d'ARN in situ et qui a le potentiel d'ouvrir de nouveaux domaines de découverte scientifique.

En outre, le G4X offrira des lectures de transcrits ciblés, de protéines ciblées et d'une coloration H&E fluorescente, le tout dans le même échantillon de tissu. Enfin, cette combinaison de modalités de lecture sera proposée à une échelle sans précédent. Avec 40 cm2 de surface d'imagerie flexible et des temps d'exécution d'une journée, le système G4X permettra aux laboratoires de traiter 20 fois plus d'échantillons par semaine que les technologies existantes.

Les premiers kits du G4X prendront en charge la transcription, la protéomique et offriront une coloration H&E fluorescente. Le système est conçu pour accueillir un grand nombre d'échantillons et lire des centaines de cibles génétiques et des dizaines de protéines dans la même section de tissu. Le contenu sera disponible sous forme de panels fixes ou personnalisables pour le client.

Les futurs kits du G4X prendront également en charge le Direct-Seq, qui est conçu pour lire directement les régions variables de l'ARN, telles que les mutations des points chauds du cancer, les ARN guides dans les écrans CRISPR ou les séquences des récepteurs des cellules B et T. La capacité d'effectuer un séquençage direct permet d'obtenir des résultats plus précis. La possibilité d'effectuer un séquençage direct de l'ARN à l'intérieur des cellules et des tissus devrait apporter une nouvelle modalité de lecture puissante pour la pathologie moléculaire in situ. Direct-Seq sera initialement disponible en tant que service, avec des plans pour une diffusion plus large peu de temps après.

Singular a déjà annoncé un programme d'accès à la technologie pour le PX, dont les enseignements ont été appliqués au développement du G4X. Dans le cadre de son programme d'accès à la technologie, Singular a collaboré activement avec des institutions de premier plan pour générer des données sur le G4X et démontrer son applicabilité dans des domaines de recherche essentiels. Principales caractéristiques attendues du G4X ?

Séquenceur spatial : Débit inégalé dans l'industrie : Une zone d'imagerie de 40 cm2 par cycle sur quatre cellules de flux spatial devrait augmenter considérablement le débit d'échantillons tout en conservant la flexibilité nécessaire pour les petits cycles. Direct-Seq : séquençage in situ de l'ARN, conçu pour séquencer des régions génétiques variables directement dans les cellules et les tissus, avec des applications potentielles en immunologie, immuno-oncologie, recherche sur le cancer et édition de gènes. Transcriptions : Des centaines de transcriptions de gènes, qui seront disponibles sous forme de tableaux de bord et de sélection de cibles génétiques personnalisées.

Protéines : Des douzaines de protéines, qui seront disponibles dans des panels classés et dans une sélection personnalisée de cibles protéiques. H&E fluorescent : superposition de la coloration H&E fluorescente avec les transcrits et les protéines sur le même échantillon de tissu. Délai d'exécution rapide : Grâce à un processus de transfert de tissus spécialisé, à un flux de travail rationalisé pour la préparation des échantillons et à un séquençage rapide en une journée, les utilisateurs pourront passer de l'échantillon à la découverte en seulement trois jours.

Rentabilité : Grâce à son débit sans précédent, le G4X réduira considérablement le coût par échantillon à moins de la moitié de celui des autres approches, ce qui rendra la multiomique spatiale plus accessible. Le système est commercialisé au prix de 495 000 dollars. Les mises à niveau du G4X devraient être disponibles pour les clients du G4 d'ici à la fin de 2024, avec un premier panel immuno-oncologique d'environ 300 transcriptions de gènes, 10 à 15 protéines, et la possibilité de personnaliser le contenu. Direct-Seq et des panels supplémentaires devraient être lancés à une date ultérieure.

Singular prévoit également de fournir des services d'accès à la technologie de séquençage spatial G4X à partir du deuxième trimestre 2024. L'entreprise prévoit de partager plus d'informations et de données lors de la prochaine assemblée générale annuelle de l'AGBT à Orlando, en Floride (du 5 au 8 février 2024).