Bionano Genomics, Inc. annonce la publication d'une étude détaillant les défis associés à la détection et à l'interprétation des variants causaux dans les maladies mendéliennes, à partir d'une cohorte de 4 577 familles. Les auteurs de l'étude ont effectué une analyse complète des échantillons de la cohorte dans lesquels des problèmes non liés au séquençage ont été rencontrés, puis ont réanalysé les échantillons en utilisant le séquençage de l'exome (ES), le séquençage du génome entier (WGS), les microréseaux chromosomiques (CMA) et la cartographie optique du génome (OGM). Ils ont constaté que la résolution de ces problèmes pourrait à elle seule augmenter le rendement diagnostique des variants causaux d'environ 71 % et souligner la nécessité d'une approche approfondie des maladies non diagnostiquées. Les auteurs de l'étude ont réanalysé et réinterprété 314 échantillons dont le séquençage clinique de l'exome ou du génome était négatif, en utilisant une combinaison de techniques traditionnelles et nouvelles, et ont pu identifier la variante causale probable dans 54,5 % des échantillons.

La MGO a été utilisée pour analyser les échantillons qui restaient négatifs après le séquençage de l'exome clinique et s'est avérée particulièrement pertinente pour la détection de grands variants qui se situaient en dessous de la limite de détection de l'AMC. L'utilité de la MGO a été illustrée dans un cas de structure généalogique où les chercheurs ont examiné les défis associés aux troubles de l'imprégnation apparaissant comme des phénotypes autosomiques récessifs. La MGO a été utilisée pour analyser trois cas pédiatriques de syndrome de malformation des mains et des pieds après que le caryotype, l'ES et le séquençage de l'ARN n'aient pas permis d'identifier une variante causale.

La MGO a révélé une duplication en tandem ayant un impact sur plusieurs gènes dans les trois cas, indiquant un mosaïcisme gonadique paternel. Outre cette découverte, les auteurs ont signalé d'autres cas où la MGO a été utilisée pour résoudre des cas impliquant des variants structurels provenant de plusieurs classes et très complexes.